El Catálogo más conocido de la rica colección que reunió Boturini es obviamente el que publicó él mismo en 1746 como apéndice a su Idea de una nueva historia de la América Septentrional. Redactado, al menos en parte, de memoria, puesto que sus papeles habían quedado en Nueva España, incluye más de trescientas piezas de las que casi siempre da una descripción relativamente precisa. Menciona en cada caso si se trata de un documento original o de una copia hecha por él. En ocasiones indica el número de fojas de que consta el documento y aun añade la naturaleza del papel, indiano o europeo. A veces señala su origen o al menos el lugar y modo cómo lo obtuvo. Finalmente, aun cuando sea con unas cuantas palabras, dice algo acerca de su contenido. En el Catálogo de Boturini se distribuyen los diversos testimonios bajo diversos rubros generales como Historia Tolteca (mapas y manuscritos), Historia Chichimeca (mapas y manuscritos), Historia Tecpaneca, Historia Mexicana (mapas y manuscritos de autores indios y de autores españoles), Historia Tlatelolca, Historias Varias, Historia de Michoacán, Historia Matlaltzinca, Historia de Huexotzinco, Historia Tlaxcalteca (mapas y manuscritos de autores indios), otros diferentes monumentos, mapas de tributos, libros raros, Historia de la Conquista (mapas y manuscritos), Historia Eclesiástica, Historia de Guadalupe, libros impresos, manuscritos, instrumentos públicos y otros testimonios. La sola mención de estos títulos, bajo los cuales se describen tantas piezas acerca de la historia prehispánica, muestra que no hay exageración en las palabras de don Lorenzo cuando afirma que esta hacienda que tiene en Indias es tan preciosa, que no la trocaría por oro y plata, por diamantes y perlas. Pero además de este más conocido Catálogo, que permite ya identificar documentos que actualmente se conservan, como procedentes de esta colección, debe recordarse que existen otros varios inventarios del mismo archivo, hechos en diversas ocasiones y con pro