Esta investigación presenta la propuesta filosófica de Xavier Zubiri como nuevo paradigma desde el que definir el desarrollo orgánico y comprender el dinamismo del embrión preimplantatorio. Además, pone de manifiesto las ambigüedades terminológicas que acompañan a las explicaciones sobre el hecho biológico en las descripciones científicas y en las reflexiones de carácter interdisciplinar. En la investigación se expone la teoría de la sustantividad y de la esencia de Xavier Zubiri, y se describe minuciosamente el desarrollo del embrión preimplantatorio a la luz de los datos científicos actuales, prestando especial atención a la epigénesis. La investigación muestra que desde el planteamiento zubiriano se puede, por un lado, describir con precisión la imbricación entre lo genético y lo epigenético y, por otro lado, definir, sin perder la unidad del organismo, la noción de desarrollo. Además, se realiza un análisis crítico de las principales posturas sobre el estatus ontológico del embrión humano y se muestra las ventajas de su abordaje desde el prisma zubiriano.