En la dedicatoria al rey Felipe II de España, en el 6 del De decimis, fray Alonso de la Vera Cruz expresa su decisión de tratar el tema de los diezmos. En efecto "en éste Nuevo Mundo empezó una contienda, o por lo menos una controversia, entre los religiosos y los prelados diocesanos, sobre si sería conveniente y necesario exigir dé los neófitos, como de los cristianos maduros, el pago de los diezmos''.., Por ello, en el segundo curso académico (1554-1555) de la recién fundada Universidad de México, fray Alonso prepara la Relectio de decimis, en la cual argumenta en contra de la pretensión de obligar a los indígenas a pagar (cuestiones 1 a 18 y la 22). Además, demostró que el pago del diezmo no de derecho divino, sino de derecho positivo eclesiástico y civil. Allí mismo (cuestiones 19-21 y 23-26) fray Alonso insiste en "la necesidad de la autonomía de los religiosos en la administración de los serviciospirituales", como ya lo había hecho en la Junta Eclesiástica del 1546, oponiéndose al obispode México, Alonso de Montufar, O.P. Como consecuencia de tales conflictos queda prohibida. la publicación de latio, que permaneció inédita en la biblioteca de El Escorial; que Ernest Burrus la publicó en el año 1976. De toda manera, la lectura de De decimis nos confirma fray Alonso fundamenta la práctica del diezmo en el Código de las Bienaventuranzas (Mt. 5, 1-14), que nos garantiza la verdadera felicidad, si aprendemos a no considerar el dinero y el poder como únicos criterios de realización.